研究发现氢气可以抑制破骨细胞的活性，延缓老化引起的骨质疏松的发生，还可以调整女性更年期卵巢功能异常导致的骨密度下降。骨质疏松是危害非常大的老化性疾病，骨质疏松后的骨折会危及老年人生命。有案例发现长期饮用氢水后老年人骨密度连续几年没有显著下降，喝氢水未来可能是一个非常好的减少骨钙流失的方法。

需要提醒的是，已经发生骨质疏松的老年人，氢气没有方法逆转骨质疏松的程度，但是可以遏制进一步的骨钙流失，同时联合钙剂和维生素D、维生素C的使用改善患者的不适症状。